Κατά την προεδρία του Αθανασίου Μανιά (1982-1985), ενεργοποιήθηκε η δωρεά του συμπολίτη μας Σωκράτη Διαμαντόπουλου για την ανέγερση του κτιρίου του μουσείου, σε οικόπεδο που παραχωρήθηκε το 1983 από το Υπουργείο Πολιτισμού.

Κατά την προεδρία του Γεωργίου Παναγιώτου (1985-1995), εξασφαλίστηκε η δωρεά του ευεργέτη της πόλης μας Φωτίου Σταυρίδη και κατασκευάστηκε το κτίριο του μουσείου, που εγκαινιάστηκε τον Νοέμβριο του 1995.

Κατά την προεδρία του Γεωργίου Μηνόπουλου (1995-2004), Ομότιμου Καθηγητή της Ιατρικής Σχολής του Δ.Π.Θ., ολοκληρώθηκε η κατασκευή του κτιρίου, χάρη και στη χορηγία του Ιδρύματος «Σταύρος Νιάρχος».

Από το 2005 αναλαμβάνει Πρόεδρος ο αρχιτέκτονας Νικόλαος Α. Πινάτζης, ο οποίος δραστηριοποιήθηκε για τη δημιουργία του Ιστορικού Μουσείου Αλεξανδρούπολης με την εκπόνηση των απαιτούμενων μελετών και τη διεκδίκηση των αναγκαίων πόρων. Στη θητεία του πραγματοποιήθηκε η λειτουργία του Ιστορικού Μουσείου Αλεξανδρούπολης, με τη δημιουργία της μόνιμης έκθεσης για την ιστορία της πόλης, που εγκαινιάστηκε τον Ιούνιο του 2011 και της μόνιμης έκθεσης με τη συλλογή της Ελένη Φιλιππίδη, καθώς και με την αναβάθμιση και τον εξοπλισμό των χώρων του Μουσείου, που εγκαινιάστηκαν τον Ιανουάριο του 2015.

Τον Μάιο του 2013, με απόφαση της Γενικής Συνέλευσης, το Σωματείο μετονομάστηκε σε «Σύλλογος Ιστορικού Μουσείου Αλεξανδρούπολης».

Από το 2015 μέχρι σήμερα το Ιστορικό Μουσείο Αλεξανδρούπολης διαθέτει μία ολοκληρωμένη μουσειακή υποδομή που άλλαξε τον πολιτιστικό χάρτη και εγκαινίασε μία νέα εποχή στα πολιτιστικά πράγματα της περιοχής. Αποτελεί μία σύγχρονη, οργανωμένη και τεχνολογικά εξοπλισμένη πολιτιστική μονάδα, ανοιχτή στην κοινωνία, φιλική στους επισκέπτες του και συμβατή με πρωτοποριακές μουσειολογικές προδιαγραφές και διαδραστικές μεθόδους. Μία κιβωτό της ιστορικής μνήμης, κέντρο διατήρησης της πολιτιστικής κληρονομιάς και χώρο προβολής κάθε έντεχνης δημιουργίας, επιτελώντας έναν σύνθετο και πολυδιάστατο ρόλο: πολιτιστικό, ερευνητικό, επιστημονικό, κοινωνικό και εκπαιδευτικό.